Какви изследвания на микробиома има и кое да избереш?

Изследванията на микробиома се правят по три основни начина: с PCR панел, с 16S секвениране и с shotgun метагеномно секвениране. Разликата е колко от ДНК-то в пробата чете всеки метод и затова до каква подробност стига. Панелът търси предварително избрани бактерии, 16S вижда главно бактериите до рода, а shotgun чете цялата ДНК и стига до вида.

Какво показва изследването на микробиома?

Показва кои микроби живеят в червата ти и в какво съотношение. Пробата е от изпражнения, но лабораторията не отглежда микробите, а чете тяхната ДНК. Така вижда и онези, които трудно растат в лаборатория и при обикновената посявка остават незабелязани.

Изследването на микробиома не е същото като изследването на изпражнения за инфекция или паразити. Тези изследвания търсят конкретен причинител и ги назначава лекар.

Как работи PCR панелът?

PCR панелът търси предварително избрани бактерии с набор от ДНК маркери и показва колко има от всяка. Пример е норвежкият тест за дисбиоза, описан през 2015 г. Той ползва 54 ДНК сонди, насочени към над 300 бактерии на различни нива, и сравнява резултата със 165 здрави хора.

Такива тестове са бързи и по-евтини, но виждат само това, което е в списъка. Ако в червата ти има нещо важно извън него, панелът няма как да го покаже.

Какво чете 16S секвенирането?

То чете един ген, 16S рРНК, който имат всички бактерии и археи. Генът е дълъг около 1500 нуклеотида, но повечето лаборатории четат само една или няколко негови зони с кратки откъси. В американско проучване от 2019 г. учените проверяват това с компютърен опит: при най-често четената зона, V4, 56% от откъсите не се разпознават уверено до вида. С целия ген почти всички се разпознават. Затова 16S тестовете най-често стигат до рода, например Bifidobacterium, без да казват кой точно вид е.

Гъбите и вирусите нямат ген 16S, така че този тест не ги вижда. Не показва и какви гени носят бактериите, а оттам и какво могат да правят в червата ти.

С какво е различно shotgun метагеномното секвениране?

Shotgun методът чете цялата ДНК в пробата на малки парчета, без да избира предварително какво да търси. Така вижда бактерии, археи, гъби и вируси, стига до вида и показва гените на микробите, тоест какво могат да правят. Обзор в Nature Biotechnology от 2017 г. го описва като метода, който позволява да опознаем микробните общности и тяхната работа, включително микробите, които не растат в лаборатория.

Сравненията между двата метода стигат до същия извод. В американско проучване от 2016 г. една и съща проба от изпражнения е изследвана по двата начина и shotgun открива повече видове, повече разнообразие и повече гени. В испанско проучване от 2024 г. 156 проби от изпражнения са изследвани и с 16S, и с shotgun. Сред видовете, открити в поне 5% от пробите, shotgun намира 466, а 16S само 191. 16S е видял и някои родове, които shotgun не е открил, най-вече защото ги няма в базата, с която shotgun сравнява. Авторите все пак препоръчват shotgun за пробите от изпражнения и за подробен анализ, защото 16S дава по-голяма тежест на преобладаващите бактерии.

Shotgun анализът струва повече, защото се секвенира много повече ДНК и анализът на данните е по-сложен. Затова тестовете с PCR панел и с 16S обикновено са по-евтини.

Може ли изследването на микробиома да постави диагноза?

Не. През 2025 г. международна група експерти публикува в Lancet Gastroenterology & Hepatology общо становище за изследванията на микробиома. Според тях доказателствата за полза в лечебната практика засега са оскъдни, а много тестове се продават директно на хората без общи правила. Затова предлагат минимални изисквания към тестовете, включително към метода на анализ и към доклада.

Изследването на микробиома дава информация за храненето и начина на живот. Ако имаш оплаквания, първо иди на лекар.

Какво показва чревният тест BugSpeaks?

Тестът за чревен микробиом е с shotgun метагеномно секвениране: показва над 100 показателя и разпознава микробите до вида. ДНК-то от пробата се сравнява с референтна база от 247 728 генома, а тестът улавя микроби с дял от около 0,001%. В доклада от 48 страници виждаш:

• ·Разпределението по царства: бактерии, археи, гъби, еукариоти и вируси, по скала със 7 зони.
• ·Индекса на Шанън: колко разнообразни са микробите ти в сравнение с референтната група.
• ·36 вида основна микробиота, сред тях Faecalibacterium prausnitzii, Prevotella copri, Roseburia и Bifidobacterium.
• ·42 пробиотични вида и 52 вида от раздела „Опортюнистични микроби“, всеки поотделно.
• ·Потенциала на микробите ти да произвеждат 9 късоверижни мастни киселини, 9 витамина и 10 невротрансмитера.
• ·Гени за резистентност към 90 антибиотика и антимикробни вещества. Това не е антибиограма.
• ·Пет здравни показателя и раздел, който сравнява микробите ти с микробните профили, наблюдавани при 8 състояния, и показва доколко си приличат, в проценти.
• ·Rych Index™: обща оценка на чревното здраве от 0 до 100.

По резултата получаваш 12-седмичен хранителен план в 3 фази с около 250 храни в 11 групи. Подходът е клинично изпитан в пилотно рандомизирано проучване на Leucine Rich Bio с контролна група (PeerJ, 2024): след 90 дни разнообразието на чревните микроби в групата с плана се е повишило статистически значимо. Резултатите ти се сравняват с референтни групи от здрави хора от различни части на света.

Тестът струва 360 € с комплекта, безплатната доставка до теб и обратно и хранителния план. Докладът е готов до 16 работни дни, след като получим пробата. Това е информация за микробите ти, не диагноза, а приликата с профилите при 8-те състояния не предвижда дали ще развиеш някое от тях. Всички показатели един по един ще намериш в статията какво ще научиш от теста за чревен микробиом.

Кое изследване на микробиома да избереш?

• ·Ако имаш оплаквания, започни от лекар. Той ще назначи изследванията за инфекция, възпаление или непоносимост, които наистина ги показват. Защо IgG тестът за храни не е сред тях, обясняваме в отделна статия.
• ·Ако искаш да провериш няколко конкретни бактерии, може да ти стигне PCR панел.
• ·Ако искаш да видиш всички микроби до вида, какво могат да правят и какво да ядеш според тях, избери shotgun изследване.

Каквото и да избереш, питай лабораторията кой метод ползва, до какво ниво стига (род или вид), с кои хора сравнява резултата ти и какво точно получаваш в доклада.

Кога да отидеш на лекар?

Отиди на лекар при кръв в изпражненията, отслабване без причина, диария или болки, които те будят нощем, и при промяна в изхождането, която не минава няколко седмици. Изследването на микробиома не замества прегледа.

Накратко:

• ·PCR панелът търси предварително избрани бактерии. Бърз е и по-евтин, но вижда само това, което е в списъка.
• ·16S чете един бактериален ген и най-често стига до рода. Гъбите и вирусите не вижда.
• ·Shotgun чете цялата ДНК в пробата, стига до вида и показва гените на микробите. В сравнение от 2024 г. със 156 проби е открил 466 вида срещу 191 при 16S.
• ·Нито едно изследване на микробиома не е диагноза. Международното становище от 2025 г. казва, че доказателствата за лечебна полза засега са оскъдни.

Тази статия е с образователна цел и не замества съвет от лекар.